钠長石：草酸或盐酸可去铁锈；通常用清水洗就可以；硫酸可除去有机物的黑痕。
萤石：盐酸可除去表层上的方解石。
石榴石：用硬刷子或细針除去云母盖层；草酸除去铁锈；纤蛇紋石和石棉纤维可用手除去。
金、铂：铁锈可用大部份的酸除去；水晶包裹外层可用氟酸溶去；金子很软，不要刮伤样品。
石膏：用水洗去泥巴。
石盐：不可用水洗，改用酒精。
蓝铜矿：以含少量氨的水清洗，再浸泡于清水中，最后浸入丙酮；此法不要用于染蓝銅孔雀石。
白铁矿：先以温水洗，再加氨，再泡清水，最后泡丙酮以除去水分；分解的白铁矿有硫黃气味。
云母族：一般的酸就够用，但若用水可以把层片分开。
微斜長石：草酸可除去铁锈，浓盐酸可除去赤铁矿塗层。
雌黄：用醋酸溶去方解石里层。
葡萄石：用硫酸盐酸除去不要的里层，但可能会使葡萄石表面粉化，藏在纤维內的铁锈无法除去。
淡紅银矿：先擦一擦，再用超音波清洗可能除去因曝光而有的表面变化。
黄铁矿：铁锈可用草酸除去，水晶塗层可用氟酸溶去。
水晶：用草酸除去铁锈，盐酸除去方解石裹层，泡過温暖的清洁液后，不可急冷。
银：泡于氰酸鉀或氰酸钠溶液可除去黑污，然后用清水洗，不要*近含硫物质。
闪锌矿：用盐酸除去方解石，但动作要快，以免把表面弄鈍了。
锂辉石：氟酸可除去含铁的泥土矿物类。
黃玉：草酸除去铁锈，氟酸除去泥土。
电气石：氟酸除去泥土，但动作要快，以免把表面弄鈍了。
钒铅矿：有机酸可除去方解石。
蓝铁矿：储藏在湿暗环境中，以保持它的顏色和构造稳定。
矽鋅矿：挑去方解石裹层，不可用酸类。
角銀矿：可溶于氨水。
硫黃：可溶于二氧化硫。
黃铁矿、白铁矿、磁黃铁矿：应先用水清洗；但若不使用水洗，白铁矿可以保持更久。
酒精可将塗胶和油酯，以及矿物上的手指痕跡除去。
丙酮可除去胶漆。
青苔等可先用針除去，再泡于氨水，最后用水清洗。
四氯化碳可除去晶体上的熏烟；此药水很毒，请在室外操作。
晶体上若有硬泥土，無法用水泡軟除去時，可用亚硫酸钠浓液（一份亚硫酸钠兑四份水）中煮。
针状矿物的清理
针状矿物是玩石家清理工作的魘梦，一不小心就会碰断针状結晶，有一些非常纤细，甚至无法用口吹气除去杂物，只能以电扇远远的轻吹，或是使用吹镜头的橡皮球；有时可用吸尘器吸去灰尘。若是可能，将矿物样品倒着拿，轻轻地从底（上）拍几拍，夾于晶体中松散的杂质颗粒或许可以除去，可是此法对于脆硫锑铅矿和赤铜矿，可能行不通，因为这些矿物通常沒有粘在底石上，倒着拍一拍，所要的矿物也会掉到地下来。除此之外，对于那些粘在晶体上的杂质，可用尖長的夾子，小心翼翼地取出。這些矿物，若结晶很细，最好不要泡到任何液体之中，因为纤细的晶体会粘在一起，水分干后不会恢复原状；若是较粗的结晶，如钠沸石和中沸石等，可以用水洗，不过，最好先试验一下，比较保险，得到经验之后，就可知那种矿物可用水洗，那种不能泡水。
重新检查
矿物样品一旦清洗完毕、水分干了以后，必須重新检查一遍，看看是否有殘留未去的小泥土等等，若有的話，可用牙医师的挑針，或是竹牙竹签等细尖物，很小心地把它们除尽；若有需要重新裁剪的，则予以重新裁剪，不可马虎。
矿物样品经过上述的剪裁和清洗之后，整个外观会有很大的改变，简直判若两物，原来在野地土里士气不太起眼的東西，整理出来竟然会如此地美丽﹗叫人很难相信。
不过，到此地步的矿物样品，还是拿不上台面，还差了最后几道工夫：矿物的鉴定、包裝和标示；若是這三项功课做得合宜，前面所花费的一切苦工才有价值，否則，一切辛劳全都泡汤。可見得工夫要下得深，这种嗜好在投进心血、时间、学习和考证之后，价值才会大大彰显出来，其益智功能是很难用金钱衡量的。